Masalah Elkan Baggott bermula saat dia tidak memenuhi panggilan memperkuat timnas U-23 melawan Guinea di Prancis pada 9 Mei lalu. Padahal saat itu, Garuda Muda tengah membutuhkan tambahan pemain belakang menyusul kartu merah yang diterima Rizki Ridho pada laga terakhir di Piala Asia U-23 2024.
Indonesia akhirnya kalah 0-1 dari Guinea dan gagal melaju ke Olimpiade Paris 2024.
Setelah kejadian itu, Baggott tidak dipanggil lagi oleh STY. Namanya tidak ada dalam daftar 22 pemain yang dipersiapkan menghadapi Irak dan Filipina di Jakarta, Juni nanti. Padahal, dia terbilang 'anak emas' STY yang selalu jadi pilihan utama di sektor pertahanan tim Merah Putih.