Saat ini, ia menjabat sebagai Ketua Lembaga Kebudayaan dan Kesenian (LKKS) PP Muhammadiyah periode 2022-2027.

Fajar memulai pendidikannya di Fakultas Agama Islam Universitas Muhammadiyah Surakarta (UMS), tempat di mana ia meraih gelar sarjananya pada tahun 2002.

Pada saat yang sama, ia juga memperdalam ilmu agama sebagai santri di Pondok Muhammadiyah Hajjah Nuriyah Shabran. Di UMS, Fajar tidak hanya menonjol sebagai mahasiswa berprestasi, tetapi juga aktif dalam kegiatan sosial dan politik kampus.

Keaktifan Fajar dalam organisasi dimulai dari Ikatan Mahasiswa Muhammadiyah (IMM), di mana ia menjabat sebagai Ketua Pimpinan Cabang IMM Sukoharjo pada periode 2000–2001.

Keterlibatan aktifnya dalam IMM terus berlanjut, hingga ia dipercaya menjadi Ketua Dewan Pimpinan Daerah IMM Jawa Tengah dan akhirnya menduduki posisi penting di tingkat nasional sebagai pengurus di Dewan Pimpinan Pusat IMM.

Setelah menyelesaikan sarjananya di UMS, Fajar melanjutkan pendidikan pascasarjana di Center for Religious and Cross Cultural Studies di Universitas Gadjah Mada (UGM), Yogyakarta, dan lulus pada tahun 2006.

Di sini, ia mendalami kajian lintas budaya dan agama, bidang yang semakin memperkaya perspektifnya dalam memahami berbagai dinamika sosial, politik, dan agama di Indonesia.