Selain itu, Suswono aktif sebagai Pengurus Pelajar Islam Indonesia (PII) Daerah Tegal dan menjabat sebagai Ketua PII Komisariat Slawi. Dalam ranah pemerintahan, Suswono pernah menjadi Tenaga Ahli Menteri Kehutanan dari tahun 1999 hingga 2001, dan kemudian terpilih menjadi Anggota DPR RI untuk periode 2004-2009.

Selama periode tersebut, ia dipercaya menjadi Ketua Komisi IV DPR RI dari tahun 2005 hingga 2009. Setelah itu, Suswono diangkat menjadi Menteri Pertanian dalam Kabinet Indonesia Bersatu II dari tahun 2009 hingga 2014.

Setelah menyelesaikan tugasnya sebagai Menteri Pertanian dan tidak berhasil meraih kursi legislatif pada Pemilu 2014, Suswono mencalonkan diri sebagai Bupati Brebes dalam Pilkada Serentak 2017. Namun, ia kalah dalam pemilihan tersebut, bersaing dengan pasangan Idza Priyanti dan Narjo pada Pilbup Brebes 2017.