Meskipun mendapat kritik tajam terkait kunjungannya ke Israel, Yahya Cholil Staquf memberikan penjelasan bahwa tujuannya ke Israel adalah niat pribadi tidak mengatasnamakan Indonesia maupun lembaga tertentu. 

"Kalau soal kunjungan saya ke Israel ya saya tidak perlu bikin pernyataan lagi, Googling aja beritanya sudah ada, wong itu tahun berapa itu 2018. Googling sendiri aja masa saya ngomong," kata Gus Yahya saat acara halalbihalal di kantor PBNU, Jakarta Pusat.